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大會首次使用“鄧小平理論”概念，提出了社會主義初級階段的基本綱領，規劃了跨世紀發展的戰略部署。這次大會是在我國改革開放和社會主義現代化建設發展的關鍵時刻召開的，是在世紀之交，承前啟后，繼往開來，保證全黨繼承鄧小平同志遺志，堅定不移地沿著十一屆三中全會以來正確路線勝利前進的大會。
這次修改黨章集中在一個重大問題上，即在黨章中明確規定，把鄧小平理論確立為黨的指導思想。黨章總綱規定：“中國共產黨以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論作為自己的行動指南。”
